Infectiile de tract urinar sunt un lucru obisnuit la pacientii cu excretie ureterala compromisa (elul 87-l). La pacientii imunocom-promisi, Candida, care are o predilectie pentru rinichi, poate invada parenchimul renal fie pe cale hematogena, fie pe cale retrograda (a ca urinara - uretere). Prezenta bolii invazive este sugerata de candiduria persistenta sau de prezenta "ghemurilor de fungi\". Funguria persistenta (cu Aspergillus sau Candida) trebuie sa orienteze catre decelarea unui sediu de infectie in rinichi.
Anumite rusuri se intalnesc tipic numai la pacientii imunodeprimati. Virusul BK (polyomarus hominisl) a fost gasit in
urina primitorilor de transt medular, putand fi asociat cu cistita hemoragica, la fel ca adenorusurile. Cistita indusa de rusul BK, de obicei, se remite odata cu ameliorarea imunodepresiei. Tratamentul cu ribarina, in caz de cistita hemoragica severa prin infectie cu adenorusuri la pacientii imunocompromisi, nu a dat decat rezultate intamplatoare.