Virusul encefalitei japoneze se gaseste in toata Asia, inclusiv in estul extrem al Rusiei, Japonia, China, India, Pakistan si Asia de Sud-Vest si determina epidemii ocazionale in insulele Pacificului de vest. Recent, rusul a fost identificat in insulele Tores Strait, in apropierea continentului australian. Acest flarus este deosebit de frecvent in zonele unde campurile de
orez irigate atrag gazda naturala aara vertebrata si ofera locuri abundente de inmultire pentru tantari precum Culex tritaeniorchyncus, care transmit rusul la om. Amplificarea suplimentara de catre porci, care sufera avorturi si de catre cai, care dezvolta encefalita, poate fi, de asemenea, semnificativa. Vaccinarea acestor gazde amplificatoare aditionale poate reduce transmiterea rusului.
Un vaccin eficient, inactivat cu formaldehida, purificat, din creier de soarece este produs in Japonia si este autorizat pentru uzul uman in Statele Unite. Acesta se administreaza in zilele 0, 7 si 30 sau - cu unele sacrificii asupra titrului seric de
anticorpi neutralizanti - in zilele 0, 7 si 14. Vaccinarea este indicata persoanelor ce calatoresc vara in zonele rurale ale Asiei, unde riscul de a face boala clinica poate fi de 0,05 pana la 2,1/10 000 pe saptamana. Boala severa si deseori fatala raportata la expatriati trebuie pusa in balanta cu sansa de 0,1-l% de a dezvolta reactii alergice tardive sistemice sau cutanate. Aceste reactii sunt rareori fatale, dar pot fi severe si se stie ca incep la 1 pana la 9 zile dupa vaccinare, avand asociat prurit, urticarie si angioedem. Vaccinurile i atenuate se folosesc in China, dar nu sunt recomandate in Statele Unite in acest moment.