La aproximativ 30 la suta din femeile cu disurie acuta, mictiuni frecvente si piurie, culturile urinii din mijlocul jetului fie nu arata nici o crestere bacteriana, fie arata o crestere bacteriana nesemnificativa.
Clinic, aceste femei nu pot fi deosebite usor de cele cu cistita. In aceste situatii, deosebirea trebuie facuta intre femeile cu infectii cu patogeni transmisi sexual cum sunt C. trachomatis, Neisseria gonorrhoeae sau rusul
herpes simplex si cele cu infectie cu numar redus de E.
coli sau infectie stafilococica a uretrei si cii. La femeile cu un episod progresiv de boala, fara hematurie, fara
durere suprapubiana si cu un istoric al simptomelor mai mare de 7 zile, trebuie suspectata o infectie chlamidiana sau gonococica. Istoricul suplimentar de schimbare recenta a partenerului sexual, mai ales daca partenerul sexual al pacientei a avut recent o
uretrita chlamidiana sau gonococica, trebuie sa creasca suspiciunea de infectie transmisa sexual, la fel ca si gasirea unei cercite mucopurulente. Hematuria macroscopica, durerea suprapubiana, episodul brusc de boala, durata mai mica de 3 zile a bolii si istoricul de infectie anterioara de tract urinar sustine diagnosticul de infectie cu E. coli a tractului urinar.