Protei-noza alolara pulmonara (PAP) poate intra in categoria BPI, datorita simptomatologiei clinice si a aspectului
radiologie pulmonar asemanator, cu opacitatile difuze de tip alolar si/ sau nodulare dispuse radial dinspre regiunile hilare. Din punct de dere histologic, alolele sunt pline cu material granular care se coloreaza cu PAS (periodic acid Schiff), dar au un aspect inflamator si septuri cu structura relativ normala. La drept vorbind, PAP este un proces intraalolar care seamana cu, dar care nu este BPI. Deoarece manifestarile proteiniforme pot aparea in urma inhalarii dirselor pulberi (siliciu sau aluminiu), in dirse afectiuni maligne si in
infectiile cronice, denite in aceste situatii PAP secundare, aceste entitati trebuie diferentiate prin
biopsie pulmonara de PAP primare. Continutul intraalolar este o combinatie intre surfactantul fosfolipidic produs de pneumocitele de tip II, lactat dehidrogenaza si alte tipuri de proteine sau imunoglobuline din lichidul de pe suprafata alolelor. Macrofagele prezinta fagolizozomi giganti, care au o capacitate mica de fagocitoza in vitro, dar infectiile pulmonare sunt relativ rare cu agenti neobisnuiti. Lavajul pulmonar produce la multi pacienti disparitia
dispneei si a deteriorarii progresi a oxigenarii arteriale, asigurand un beneficiu pe termen lung.