In timpul delivrentei, gonococul poate infecta conjunctiva, faringele, tractul respirator sau canalul
anal al nou-nascutului. Riscul infectiei creste cu ruptura precoce a membranelor. Prevenirea oftalmiei gonococice prin administrarea profilactica a picaturilor oculare de nitrat de argint 1% sau a preparatelor oftalmice continand eritromicina sau tetraciclina este o masura eficace din punctul de vedere al costului in multe zone ale lumii, inclusiv in Statele Unite. Totusi, o data cu aparitia NGRT, nu este cert ca profilaxia oftalmica cu tetraciclina este eficienta in prevenirea conjunctitei neonatale cauzate de aceste tulpini de N. gonorrhoeae. Deoarece nou-nascutii si sugarii mici nu poseda
anticorpi IgM impotriva N. gonorrhoeae, ei prezinta un risc crescut de bacteriemie gonococica. Pe parcursul primului an de ata, infectia
sugarului se datoreaza infectarii accidentale a ochiului sau vaginului de catre un adult cu conditii precare de igiena. Intre varsta de 1 an si pubertate, multe cazuri de gonoree in S.U. A. constau in vulvo-vaginite la fetitele care au fost molestate, iar consideratiile medico-legale necesita un diagnostic bacteriologic complet si consultul starii de sanatate a copilului. Auxo-tiparea si serotiparea tulpinilor izolate de la ctima agresata sexual si de la cel acuzat a fi comis agresiunea sunt utilizate ca probe in instanta.