Tehnicile de analiza moleculara dau posibilitatea identificarii macromoleculelor specifice din cadrul unei populatii largi, permitand astfel analiza lor structurala si functionala. Acizii nucleici si proteinele sunt macromolecule relativ sile care pot fi extrase din tesuturi proaspete sau culturi de celule. Etapele acestui proces implica liza celulara (omogenizarea), separarea si purificarea ADN-ului si proteinelor din fragmentele celulare, urmeaza o serie de procedee care permit chiar elucidarea structurii si functiei genelor si a produsului lor. Analiza modificarilor care apar in ADN-ul celulelor normale si canceroase este relativ usor de efectuat cu ajutorul enzimelor de restrictie (inginerie genetica). Aceste enzime sunt nucleaze care pot scinda ADN-ul cu multa precizie intr-o anumita pozitie a lantului nucleotidic. Ca urmare a restrictiei enzimatice se produc segmente de dirse marimi. Aceste segmente creaza un polimorfism al ADN, care poate fi identificat prin tehnica Southern Blot. O a doua trasatura a activitatii enzimei de restrictie este ca adesea creaza capete terminale adezi ("sticky ends\").
Esantioanele de acizi nucleici (ADN+ARN) si proteinele extrase din diferite materiale biologice (limfo-cite, tumori) sunt separate in functie de marimea lor prin electroforeza. Caracterizarea biochimica si functionala a acestora se realizeaza cu ajutorul unor sonde moleculare sau a unor
anticorpi marcati. Principala tehnica folosita pentru analiza ADN se numeste Southern Blot si pentru analiza proteinelor - Western Blot. Cu tehnica Southern Blot se identifica fragmente scurte de ADN care migreaza la distanta maxima de locul de origine si fragmente lungi de ADN care raman in apropierea locului de pornire (3, 34).