Spre deosebire de trizomia autozomala, un cromozom sexual suplimentar duce la efecte fenotipice moderate. Acest fapt are loc deoarece cromozomii X suplimentari din setul celulelor somatice sunt de obicei inactiti aproape in totalitate, regiunea pseudoautozomala este mult mai scurta decat oricare autozom si portiunile strict legate de sex ale cromozomului Y contin putine gene. Locusurile X-legate genetic de cromozomul X (spre deosebire de locusurile autozomale) functioneaza normal in cantitati unice; femeia este un hemizigot functional pentru majoritatea locusurilor de pe cromozomul X prin efect Lyon; barbatul, and un singur cromozom X, este hemizigot pentru genele X-linkate, cu exceptia locusurilor aglomerate in segmentul pseudoautozomal si a cator locusuri imprastiate in regiunile proximale ale Yp si Yq. Adaosul unui cromozom
sexual suplimentar are un efect fenotipic, insuficient pentru a afecta supravietuirea intrauterina. Deoarece adeseori lipsesc defectele anatomice majore, barbatii cu cariotip 47XXY si 47XYY si femeile 47XXX de cele mai multe ori scapa recunoasterii.
Sindromul Klinefelter (modulul 339) consta, in forma clasica, din
testicule mici, infertilitate, ginecomastie si diferite grade de subandrogenizare, uneori cu deficit mental moderat, comportament antisocial sau cu ambele. Este consecinta prezentei unui cromozom X suplimentar in cariotipul masculin: 47XXY Cromozomul X suplimentar interfera cu supravietuirea celulelor germinale, consecinta fiind atrofia tubilor spermatici si azoosper-mia. Uneori, efectele fenotipice sunt moderate, atrofia testiculara fiind singura trasatura remarcabila la un barbat sanatos in rest si adaptat social. Mozaicismul 46XY/47XXY apare uneori si poate ameliora efectul fenotipic al cromozomului X suplimentar. Atunci cand apar mai multi cromozomi X suplimentari in cariotipul masculin normal (48XXXY sau 49XXXXY) se produc efecte fenotipice mai ample si retardare mentala.
Efectul fenotipic al cariotipului 47XYY este mai putin bine definit; desi pot apare frecvent cresterea in inaltime, dificultati comportamentale si infertilitate, uneori cromozomul Y suplimentar este descoperit la barbati normali clinic. Cariotipul rar intalnit 48XXYY duce la infertilitate. Fenotipul asociat cu 47XXX este, de asemenea, slab definit; desi femeile cu deficit mental moderat, psihoza si
tulburari menstruale au uneori acest cariotip, el este descoperit si la femei normale, sanatoase.
Pierderea cromozomului Y sau a celui de-al doilea cromozom X are efecte drastice asupra dezvoltarii. Daca nu duce la
avort (dupa cum s-a discutat deja), poate fi recunoscuta sau nu la nastere. Laxitatea plicilor pielii nucale si
edemul mainilor si picioarelor la o fetita nou-nascuta, cu sau fara anomalii
renale sau cardiosculare, pot sugera diagnosticul de cariotip 45X. Sindromul Turner (disgenezia gonadala) reprezinta manifestarile ulterioare din cursul vietii (modulul 339): statura redusa, infantilism al organelor genitale externe si interne feminine, gonade fara celule germinale, denumite creste gonadale, si diferite anomalii renale, cardiosculare, osoase si ectodermice.
Sindromul Turner poate fi consecinta fenotipica a altor constitutii cromozomiale in afara de 45X. Mozaicismul sau alte anomalii structurale afectand anumite segmente ale celui de-al doilea cromozom sexual, fie Y, fie X, produc un spectru de afectiuni atat la nivel clinic, cat si la nivel citogenetic. Anomaliile comune ale cromozomilor X si Y cuprind formarea de izocromozomi (un brat deletat si celalalt duplicat) sau deletia partiala sau totala a unui brat. La unii indivizi afectati, toate celulele au 46 de cromozomi, cu un cromozom X normal si un cromozom X sau Y anormal, de exemplu, 46XXp-, deletia unui segment de pe bratul scurt al unui cromozom X. Alteori poate fi prezenta o a doua sau o a treia componenta celulara, de exemplu, 45X/46XX/46XXp-. Sindromul Turner tipic poate fi gasit in asociere cu diferite combinatii ale acestor cariotipuri, daca unul dintre ele este monozomic sau partial monozomic pentru X. Totusi, atunci cand celulele purtatoare de cromozom Y coexista cu celulele 45X, de exemplu, 45X/ 46XY, apare adesea o ambiguitate genitala, morfologia gonadelor riind de la creste la testicule functionale (sindromul de disgenezie gonadala mixta); cand o linie celulara Y este prezenta, atunci riscul de neoplazie gonadala este semnificativ. Atunci cand celulele 46XX coexista cu celule 45X, se pot mentine diverse grade ale functiei oriene, inclusiv ovulatia. Astfel, fenotipul asociat cu monozomia X si anomalii structurale ale cromozomilor X sau Y riaza de la aspectul masculin, trecand prin sindromul Turner, pana la cel feminin.